Desenvolvimento de Aplicação WEB para automatizar o pacote de softwares de docking e prospecção de novos fármacos Autodock voltar para a edição atual

EDUARDO HERNANY PANTOJA DE MACEDO

Sob orientação de Fernando Berton Zanchi
Docking molecular é uma técnica computacional amplamente difundida entre os atores da indústria farmacêutica pois é uma das mais poderosas ferramentas usadas na prospecção de novos fármacos e Química Medicinal. Esta técnica tem sido usada extensivamente na descoberta ou no planejamento de novos ligantes quando o alvo é uma proteína por exemplo. As ferramentas mais citadas e utilizadas são as que compõem o pacote Autodock, contudo, estas não possuem uma interface WEB amigável para facilitar os ensaios executados para usuários não especialistas em informática. Uma interface gráfica em ambiente WEB multiplicaria o número de abordagens de proposição de novos candidatos a fármacos. Atualmente os softwares citados possuem algumas interfaces gráficas para instalação. Contudo, todas são aplicações conhecidas por “aplicações desktop” pois precisam ser instaladas para um sistema operacional esepecífico e ainda necessitam de bibliotecas e algumas adaptações para que funcionem. Em outros casos, as interfaces gráficas são comercialmente inviáveis. Inspirado no sucesso de outro projeto executado pelo mesmo programa PIBIT – o VisualDynamics (http://visualdynamics.fiocruz.br/login), deseja-se disponibilizar mais uma ferramenta de prospecção de fármacos na WEB. Assim, este subprojeto pretende construir uma plataforma amigável com a construção de uma interface gráfica na WEB que possibilite o uso do Autodock e do Autodok Vina.. A linguagem utilizada será Python com framework FLASK além de Javascript, HTML e CSS para designer visual aprimorado.
Palavras-chaves:DINÂMICA MOLECULARPYTHONFLASKBIOINFORMÁTICA ESTRUTURALPROSPECÇÃO DE FÁRMACOSPLASMODIUM FALCIPARUMBIOTECNOLOGIA.BIOTECNOLOGIA Área de conhecimento (CNPq): Biologia Geral Linha de pesquisa na FIOCRUZ: 9.4. Abordagens computacionais para a seleção de alvos e desenho de fármacos baseado na estrutura