Mapeamento fino dos genes NOS3, CBS e BHMT do ciclo do folato em busca de variantes comuns para estudo de associação de fenda labial com ou sem fenda palatina voltar para a edição atual

A fenda oral (FO) é um grave problema de saúde pública, visto que requer um complexo tratamento multidisciplinar de longo prazo. A sua maioria não está relacionada a síndromes e possui etiologia complexa. A FL±FP (fenda labial com ou sem fenda palatina) é o tipo mais comum de FO com uma prevalência de 1 a 2 casos a cada 1.000 nascimentos. A identificação de genes contribuindo para o aumento do risco das FO tem sido um desafio da atualidade. Alterações estruturais maiores do genoma chamadas de variações do número de cópias (CNVs) são amplamente estudadas em indivíduos portadores de FO. Resultados preliminares de varredura ampla do genoma por microarranjos de genotipagem com marcadores SNP e CNV do nosso grupo em uma amostra de 30 famílias de uma população com alta frequência de FO identificaram 28 regiões CNV de novo - 5 das quais foram deleções (perdas não homogêneas) e 23 duplicações: 6 regiões contendo genes previamente associados com FO (GLI2, PKP1, MKX, PVRL1, CDH1 e TYMS) e 22 segmentos genômicos sem histórico prévio de associação com FO, como regiões candidatas a FL±FP não sindrômica. A etapa seguinte foi o mapeamento genético fino da região 18p11.32 que contém o gene TYMS,por ter sido o único locus de deleção com gene já descrito na literatura como candidato a FO. O TYMS é um dos genes envolvidos do ciclo do folato. Identificamos 10 variantes em TYMS e em outros dois genes importantes do ciclo do folato (MTHFR e MTHFD1) que foram genotipadas por meio de PCR em tempo real em 336 indivíduos pertencentes à 132 famílias da mesma região. Em seguida realizamos as análises estatísticas pertinentes, dentre elas: o teste de desequilíbrio de transmissão, a análise de haplótipos e a interação gene x gene. Estes resultados já foram submetidos a um periódico internacional indexado e em breve serão publicados. Durante essa fase do projeto, após criteriosa revisão de literatura, ampliamos o interesse pelo ciclo do folato através dos genes NOS3, CBS e BHMT, que interagem com TYMS e foram previamente associados à FO em população hispânica dos EUA. Esses três genes serão o foco deste sub-projeto de iniciação científica. O objetivo geral do sub-projeto é executar mais uma etapa do projeto maior no qual está inserido, contribuindo para o entendimento dos principais fatores genéticos na causalidade das fendas orais em regiões abrangidas pelo ECLAMC, a partir da identificação de regiões candidatas. Como objetivos específicos deste sub-projeto destaca-se a realização do mapeamento genético fino da região dos três genes alvo do ciclo do folato - NOS3, CBS e BHMT com a finalidade de sugerir novos marcadores genéticos candidatos a FO que possam ser replicados em uma população familiar mais ampla. Além disso, planeja-se realizar estudo de associação entre o polimorfismos rs2373929 no gene NOS3,pré-selecionado com base na literatura, em uma amostra composta por 132 famílias da mesma população com alta frequência de FL±FP. Para cumprir os objetivos específicos deste sub-projeto PIBIC da melhor forma possível, prosseguiremos com uma parte remota em virtude da pandemia da Covid-19 e uma parte presencial, quando possível. Este subprojeto foi ajustado de forma que, se houver impossibilidade de retorno da bolsista PIBIC às atividades presenciais nos 12 meses, o desenvolvimento do subprojeto e a capacitação da bolsista PIBIC não ficarão comprometidos. Visamos resultados que possam ser futuramente aplicados para a realidade do nosso país no que se refere ao aprimoramento do aconselhamento genético de famílias portadoras de fenda oral. Cronograma de atividades: Duração de 12 meses. Ver arquivo subprojeto completo em anexo na plataforma PIBIC.